呼吸科創(chuàng)立于20世紀(jì)60年代，是醫(yī)院優(yōu)勢學(xué)科，也是我國最早成立的兒童呼吸專科，具有悠久歷史。多年來一直是我國兒科呼吸專業(yè)領(lǐng)域醫(yī)療、科研和教學(xué)的中心，以及兒童呼吸系統(tǒng)疑難疾病的診斷治療和科學(xué)研究中心。同時(shí)是上海交通大學(xué)兒童呼吸道感染性疾病診治中心及兒童哮喘診治分中心，是兒科呼吸專業(yè)國家臨床藥物實(shí)驗(yàn)基地。呼吸科在陸敏主任醫(yī)師的帶領(lǐng)下，努力奮斗，開拓進(jìn)取、積極向上，建立了一支具有先進(jìn)醫(yī)療水平和服務(wù)意識(shí)理念，集醫(yī)療、教學(xué)、科研為一體的學(xué)科團(tuán)隊(duì)。

自2014年3月瀘定路院區(qū)啟用運(yùn)行以來，科室兩院同時(shí)運(yùn)行。其中，北京西路院區(qū)開放床位52張，包含感染、哮喘/過敏、肺間質(zhì)病、睡眠障礙、呼吸生理和肺功能等亞專科，開展了多項(xiàng)與呼吸性疾病相關(guān)的新技術(shù)和新項(xiàng)目。擁有設(shè)施齊全的專科病區(qū)(普通、A類和特需不同層次床位)。呼吸科門診包括呼吸專科門診、專家門診、特需專科門診和哮喘與咳嗽專病門診，可以滿足廣大患有呼吸系統(tǒng)疾病患兒和家長的多層次需求。擁有目前各種國內(nèi)外先進(jìn)診療設(shè)備和設(shè)施，如兒童電子支氣管鏡室、肺功能室、特異性免疫治療室、睡眠監(jiān)測室、LPR檢測室和霧化中心等，為兒童呼吸系統(tǒng)的診斷和治療、護(hù)理提供了可靠地保障。目前主任醫(yī)師1人，副主任醫(yī)師4人，主治醫(yī)師5人，副主任護(hù)師1人，主管護(hù)師6人及多名專科住院醫(yī)師和經(jīng)驗(yàn)豐富的專業(yè)護(hù)師。同時(shí)擁有專業(yè)實(shí)驗(yàn)研究團(tuán)隊(duì)。團(tuán)隊(duì)成員多年來承擔(dān)了多項(xiàng)國際和國內(nèi)重大科研項(xiàng)目,發(fā)表核心期刊論著近百篇。是上海、華東地區(qū)各大醫(yī)院兒科醫(yī)療和護(hù)理教學(xué)基地，承擔(dān)了上海市兒科住院醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)和全科醫(yī)師的培訓(xùn)工作。作為上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院、江蘇南通大學(xué)醫(yī)學(xué)院、江蘇揚(yáng)州大學(xué)醫(yī)學(xué)院和其他高等醫(yī)學(xué)院校研究生、本科、大專兒科臨床教學(xué)和實(shí)習(xí)的搖籃，為國內(nèi)兒科呼吸領(lǐng)域培養(yǎng)了大批優(yōu)秀專科醫(yī)療護(hù)理人才。