首都兒科研究所原中國醫學科學院兒科研究所呼吸研究室科創建于1958年首都兒科研究所專業代運作住院，1960年成立呼吸病房，1975年發展呼吸專業并建立呼吸功能室，并開展急性呼吸衰竭的呼吸器治療，1980年成立哮喘專業門診，1984年開展反復呼吸道感染。

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首都兒科研究所前身是中國醫學科學院兒科研究所，成立于1958年，是新中國第一家以研究兒童保健兒科疾病為重點，兼有醫療教學和預防任務的應用醫學研究機構。

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